150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3878 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2545  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  57.76 
 
 		 815 aa  862    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3878  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 		 789 aa  1600    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0187  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.08 
 
 		 812 aa  795    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17580  hypothetical protein  52.63 
 
 		 801 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3607  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.17 
 
 		 806 aa  820    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  59.77 
 
 		 808 aa  899    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  61.64 
 
 		 806 aa  919    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38520  phosphoketolase protein  53.36 
 
 		 806 aa  776    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1285  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.22 
 
 		 800 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  53.47 
 
 		 761 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3459  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  69.37 
 
 		 792 aa  1019    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1294  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  67.43 
 
 		 790 aa  1001    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  26.1 
 
 		 792 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  25.84 
 
 		 800 aa  137  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  27.19 
 
 		 782 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  25.81 
 
 		 824 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  25.89 
 
 		 798 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  25.46 
 
 		 800 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  25.62 
 
 		 860 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  24.44 
 
 		 811 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  24.37 
 
 		 811 aa  124  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  24.04 
 
 		 791 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  24.04 
 
 		 791 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  25.03 
 
 		 795 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  25.77 
 
 		 812 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  25.59 
 
 		 780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  23.79 
 
 		 848 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  24.17 
 
 		 795 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  25.03 
 
 		 851 aa  118  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  26.89 
 
 		 802 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  25.79 
 
 		 811 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  23.84 
 
 		 796 aa  117  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  24.29 
 
 		 792 aa  117  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  24.8 
 
 		 823 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  24.17 
 
 		 793 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  24.75 
 
 		 837 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  25.5 
 
 		 823 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  22.19 
 
 		 815 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  22.19 
 
 		 815 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  24.73 
 
 		 792 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  24.66 
 
 		 851 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  24.13 
 
 		 789 aa  114  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  25.03 
 
 		 833 aa  114  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  25.37 
 
 		 771 aa  114  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  24.1 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  24.28 
 
 		 789 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  24.83 
 
 		 805 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  23.37 
 
 		 795 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  23.51 
 
 		 790 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  24.54 
 
 		 811 aa  111  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  26.94 
 
 		 811 aa  111  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  24.12 
 
 		 794 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  24.67 
 
 		 811 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  24.64 
 
 		 832 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  24.64 
 
 		 800 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  23.51 
 
 		 797 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  24.63 
 
 		 797 aa  109  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  25.89 
 
 		 797 aa  109  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  25.03 
 
 		 798 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  24.69 
 
 		 791 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  23.91 
 
 		 820 aa  107  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  25.23 
 
 		 835 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  27.35 
 
 		 783 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  22.25 
 
 		 818 aa  107  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  24.13 
 
 		 791 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  22.79 
 
 		 794 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  24.29 
 
 		 795 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.31 
 
 		 828 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  24.9 
 
 		 832 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  25.71 
 
 		 788 aa  105  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  24.6 
 
 		 831 aa  105  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  23.66 
 
 		 793 aa  105  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  21.71 
 
 		 834 aa  104  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  22.52 
 
 		 792 aa  104  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  25.07 
 
 		 800 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  23.51 
 
 		 802 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  23.09 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  23.68 
 
 		 783 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  23.51 
 
 		 802 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  24.01 
 
 		 832 aa  101  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  23.95 
 
 		 798 aa  101  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  25.48 
 
 		 802 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  23.51 
 
 		 796 aa  100  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  23.55 
 
 		 784 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  23.44 
 
 		 802 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  23.72 
 
 		 807 aa  99.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  22.18 
 
 		 813 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  23.54 
 
 		 793 aa  99.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  23.51 
 
 		 821 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  24.59 
 
 		 1305 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3504  phosphoketolase  23.99 
 
 		 772 aa  99.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  23.78 
 
 		 797 aa  98.6  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  22.75 
 
 		 787 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  24.17 
 
 		 811 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  23.89 
 
 		 782 aa  98.2  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  25.85 
 
 		 1230 aa  97.8  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  25.04 
 
 		 1230 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  23.92 
 
 		 797 aa  97.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  24.16 
 
 		 1228 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  22.05 
 
 		 820 aa  97.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>