More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3590 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  67.72 
 
 
542 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1105    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  51.85 
 
 
541 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  52.5 
 
 
558 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  51.84 
 
 
541 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  50.37 
 
 
541 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  50.46 
 
 
543 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  49.44 
 
 
547 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  36.75 
 
 
569 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  35.77 
 
 
534 aa  256  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.82 
 
 
561 aa  248  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.75 
 
 
600 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.3 
 
 
552 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.68 
 
 
587 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  33.57 
 
 
578 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  31.38 
 
 
587 aa  239  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 
572 aa  237  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  32.5 
 
 
576 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.99 
 
 
585 aa  236  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  31.83 
 
 
595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.83 
 
 
595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.16 
 
 
562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.83 
 
 
595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  32.58 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.68 
 
 
552 aa  233  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.19 
 
 
553 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.46 
 
 
599 aa  231  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  30.44 
 
 
587 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.52 
 
 
596 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  33.64 
 
 
545 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.2 
 
 
584 aa  229  9e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.65 
 
 
557 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.7 
 
 
632 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.34 
 
 
592 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  31.37 
 
 
587 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.99 
 
 
566 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.52 
 
 
596 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  32.79 
 
 
545 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 
587 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
593 aa  226  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.47 
 
 
565 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  33.46 
 
 
533 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.4 
 
 
565 aa  224  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.76 
 
 
563 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 
555 aa  224  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.46 
 
 
573 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  30.99 
 
 
566 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.2 
 
 
569 aa  223  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.07 
 
 
587 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  31.77 
 
 
554 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.45 
 
 
563 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  34.8 
 
 
536 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.87 
 
 
593 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  30.2 
 
 
572 aa  222  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  30.36 
 
 
566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 
569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.41 
 
 
576 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.63 
 
 
561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.2 
 
 
547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  29.96 
 
 
535 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.11 
 
 
585 aa  221  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  30.85 
 
 
562 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 
566 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 
569 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.08 
 
 
554 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  31.22 
 
 
573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.76 
 
 
564 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.48 
 
 
597 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  30.95 
 
 
555 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.56 
 
 
563 aa  220  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  30.53 
 
 
586 aa  220  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.18 
 
 
602 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  30.63 
 
 
566 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
572 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.73 
 
 
586 aa  219  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  31.17 
 
 
638 aa  219  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  30.63 
 
 
578 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
572 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.29 
 
 
562 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1817  thiamine pyrophosphate protein central region  31.21 
 
 
595 aa  219  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
572 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
572 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.58 
 
 
554 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.52 
 
 
581 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  32.69 
 
 
536 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
572 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.35 
 
 
581 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.65 
 
 
583 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.18 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.46 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.63 
 
 
601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.98 
 
 
572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  29.96 
 
 
535 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.54 
 
 
563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
573 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
572 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.3 
 
 
572 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 
573 aa  217  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>