58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3342 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  45 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  43.64 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  45.59 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  45.23 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  44.72 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  44.22 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  44.79 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  33.02 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  31.53 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  32.2 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  36.7 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  35.35 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  42.48 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  47.32 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  38.71 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  31.82 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  46.05 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  48.33 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  40.94 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  40.94 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  51.85 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  38.64 
 
 		 95 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  49.15 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  37.63 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  37.63 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  34.88 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  46.38 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  40.3 
 
 		 104 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  31.96 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  36.05 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  38.89 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  37.97 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  48.57 
 
 		 131 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  48.94 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  47.37 
 
 		 132 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  37.5 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  38.37 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  36.62 
 
 		 104 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  43.42 
 
 		 132 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  39.06 
 
 		 312 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  32.53 
 
 		 301 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  39.06 
 
 		 312 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  36.26 
 
 		 603 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  36.26 
 
 		 603 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  41.3 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  42.59 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  42.2 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  42.59 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  30.23 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  45.26 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  47.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  41.43 
 
 		 131 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>