More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0463 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  63.05 
 
 
250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  48 
 
 
271 aa  228  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  49.38 
 
 
276 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  49.38 
 
 
285 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  50 
 
 
285 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  48.33 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  49.58 
 
 
350 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.83 
 
 
313 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
282 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  47.08 
 
 
282 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  47.35 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
308 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
659 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  46.9 
 
 
308 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  49.12 
 
 
540 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4791  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28753  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.89 
 
 
568 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4687  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 
317 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.25 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
326 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
316 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.35 
 
 
536 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4132  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.41 
 
 
322 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
339 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
338 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  45.49 
 
 
536 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 
307 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2988  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
336 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2601  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 
336 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
539 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44 
 
 
328 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0753  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
348 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  44.16 
 
 
308 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  46.75 
 
 
308 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  48.52 
 
 
537 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  46.7 
 
 
527 aa  207  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 
341 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.570854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
338 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  48.47 
 
 
534 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.89 
 
 
326 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3078  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.06 
 
 
338 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111325  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.6 
 
 
332 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 
602 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5658  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 
314 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1618  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  46.75 
 
 
322 aa  205  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.231064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7775  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.55 
 
 
419 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
536 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0775  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  44.59 
 
 
322 aa  205  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138989  hitchhiker  0.00000000000731431 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
347 aa  204  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  44.78 
 
 
575 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  46.61 
 
 
542 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.08 
 
 
325 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0429  ABC transporter related  47.84 
 
 
269 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
325 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  49.13 
 
 
536 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.4 
 
 
336 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.16 
 
 
326 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  50 
 
 
289 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3328  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 
327 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 
454 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  44.64 
 
 
332 aa  202  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 
335 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  44.64 
 
 
332 aa  202  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
325 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 
443 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.92 
 
 
322 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2624  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
331 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4501  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 
332 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.92 
 
 
320 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48 
 
 
525 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 
257 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  45.78 
 
 
555 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  41.43 
 
 
257 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
368 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.14 
 
 
658 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.28 
 
 
627 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  50 
 
 
571 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.92 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.27 
 
 
617 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
541 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 
257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  48 
 
 
525 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
548 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  45.45 
 
 
554 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
559 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  44.03 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>