218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0439 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
343 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.39 
 
 
347 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.51 
 
 
357 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.93 
 
 
341 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.3 
 
 
341 aa  339  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.3 
 
 
341 aa  338  7e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.52 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.2 
 
 
345 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.95 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.97 
 
 
337 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.64 
 
 
335 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.08 
 
 
327 aa  245  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.92 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.63 
 
 
326 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.19 
 
 
337 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.89 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.74 
 
 
327 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.77 
 
 
345 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.82 
 
 
340 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.73 
 
 
338 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.18 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.45 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.37 
 
 
343 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.61 
 
 
328 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.45 
 
 
333 aa  209  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.47 
 
 
342 aa  205  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.3 
 
 
332 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.91 
 
 
331 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  41.03 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.3 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
375 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.57 
 
 
335 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.92 
 
 
337 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.2 
 
 
332 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.81 
 
 
338 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.85 
 
 
332 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.03 
 
 
333 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.41 
 
 
331 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.2 
 
 
331 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.85 
 
 
335 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.09 
 
 
372 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.66 
 
 
353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
349 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.18 
 
 
339 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.14 
 
 
333 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.62 
 
 
341 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.85 
 
 
332 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.03 
 
 
366 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.73 
 
 
330 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.36 
 
 
331 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.9 
 
 
771 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.53 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.75 
 
 
372 aa  146  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.62 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.47 
 
 
325 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
325 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
325 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
325 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.85 
 
 
335 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.37 
 
 
325 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
331 aa  143  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.76 
 
 
330 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.64 
 
 
337 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.83 
 
 
335 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.49 
 
 
335 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.39 
 
 
315 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.43 
 
 
328 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.43 
 
 
328 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.43 
 
 
328 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.9 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.9 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  33.99 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.97 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.54 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.91 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.16 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.16 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.67 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.12 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.16 
 
 
332 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.58 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.3 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.42 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.98 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.71 
 
 
325 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  38.7 
 
 
355 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.66 
 
 
328 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.19 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.04 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.71 
 
 
325 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.92 
 
 
333 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>