More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0764 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0764  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
361 aa  716    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.58 
 
 
331 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.35 
 
 
317 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  51.94 
 
 
327 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
316 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.64 
 
 
325 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.78 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  50.16 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.87 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.24 
 
 
314 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.44 
 
 
314 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  51.77 
 
 
312 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 
314 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 
329 aa  298  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
316 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  295  9e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4123  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.33 
 
 
310 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0241029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
314 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
315 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.61 
 
 
315 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
321 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.94 
 
 
318 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
316 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.37 
 
 
309 aa  291  8e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 
342 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
315 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 
316 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 
319 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
314 aa  289  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
310 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.39 
 
 
315 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
321 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
321 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.69 
 
 
309 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.69 
 
 
309 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  47.45 
 
 
326 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
312 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
322 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
310 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 
315 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.37 
 
 
309 aa  285  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.4 
 
 
311 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 
313 aa  285  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
312 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  285  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.55 
 
 
312 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.59 
 
 
339 aa  285  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.27 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.54 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.91 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.04 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.71 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 
319 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.96 
 
 
339 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
324 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.57 
 
 
308 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.17 
 
 
324 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
315 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
314 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
316 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
314 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 
315 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.37 
 
 
319 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1558  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 
312 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
309 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.65 
 
 
339 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  47.65 
 
 
339 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
324 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.05 
 
 
327 aa  279  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.27 
 
 
317 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  279  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.27 
 
 
325 aa  279  6e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 
315 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>