30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0679 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0679  VanZ family protein  100 
 
 		 109 aa  216  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48389  normal  0.15313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2594  VanZ like protein  40.38 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1880  VanZ like protein  44.3 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  34.86 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0245  hypothetical protein  36.7 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1791  VanZ like protein  36.89 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2623  VanZ like protein  41.77 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2961  hypothetical protein  35.58 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3166  VanZ family protein  38.55 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0005  VanZ family protein  41.38 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3988  VanZ family protein  30.37 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0330326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11940  predicted integral membrane protein  36.59 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0238  VanZ family protein  26.28 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4454  VanZ family protein  48 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000015697  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0123  VanZ like protein  36.62 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1519  VanZ family protein  41.77 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000017636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0500  VanZ family protein  36.62 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000129129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3018  VanZ family protein  29.6 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0165  hypothetical protein  30.12 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0300399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23010  predicted integral membrane protein  53.49 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  27.08 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3020  hypothetical protein  34.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3602  VanZ family protein  43.62 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  33.65 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3083  VanZ family protein  43.14 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  25.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 120 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3336  VanZ family protein  46.15 
 
 		 150 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0088  acetobutylicum phosphotransbutyrylase  27.13 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.2 
 
 		 392 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>