35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1519 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  59.66 
 
 
236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  59.4 
 
 
237 aa  261  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  59.15 
 
 
238 aa  256  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  55.79 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  45.8 
 
 
253 aa  194  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  49.79 
 
 
237 aa  186  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  43.28 
 
 
237 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  40.27 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  36.25 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  32.91 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  42.63 
 
 
247 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  33.47 
 
 
247 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  33.89 
 
 
247 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  33.2 
 
 
247 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  45.55 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  50.28 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  42.49 
 
 
255 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  45.31 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  44.1 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  43.28 
 
 
247 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  40.72 
 
 
245 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  43.75 
 
 
244 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  36.87 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  34.25 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  36.32 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  36.5 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  33.54 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  37.4 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  35.82 
 
 
302 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  35.58 
 
 
313 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  34.62 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  33.08 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>