27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5406 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  46.55 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  42.77 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  34.81 
 
 		 325 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  35.29 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.88 
 
 		 584 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  32 
 
 		 942 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 383 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  31.33 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  28.47 
 
 		 327 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  27.59 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  29.79 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  30.08 
 
 		 135 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  32.35 
 
 		 364 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  26.71 
 
 		 851 aa  60.1  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  27.97 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  34.26 
 
 		 1656 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  39.76 
 
 		 1363 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  25.53 
 
 		 585 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  31.87 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  29.25 
 
 		 552 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  32.22 
 
 		 598 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.94 
 
 		 1348 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  34.74 
 
 		 1048 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  30.86 
 
 		 137 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  27.36 
 
 		 552 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>