214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4157 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  98.72 
 
 		 391 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 		 391 aa  764    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  80.45 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  58.97 
 
 		 382 aa  356  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.98 
 
 		 382 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.86 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  42.3 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  44.65 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.28 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.06 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  33.45 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  31.6 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  31.96 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  29.6 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  29.14 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  31.27 
 
 		 347 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  34.16 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  32.5 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  31.85 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  29.32 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  29.02 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  30.04 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  28.7 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.48 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  29.63 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.1 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.74 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11010  acyl-CoA dehydrogenase  27.91 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  22.67 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1952  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.27 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.73 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.06 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.45 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  27.23 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.87 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.23 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.1 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.87 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.87 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1866  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  21.43 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.93 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.24 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  24.32 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  35.11 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2352  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.09 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2310  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.09 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.23 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.23 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1361  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.88 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.84 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.66 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  22.97 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.67 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.97 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.46 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.03 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.32 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  29.35 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1168  putative acyl-coa dehydrogenase  21.8 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  27.49 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.77 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.52 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  25.82 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.45 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.04 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.52 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3255  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.33 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.01 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  26.02 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  25.82 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  26.2 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.42 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0949  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.51 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0416018  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.65 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.48 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.12 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  23.51 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4265  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.54 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.184931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  27.87 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.93 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.95 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  26.69 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  27.96 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.66 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4695  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.53 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2538  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.68 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.844573  decreased coverage  0.00557828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  27.21 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  23.99 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3695  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.53 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.451593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.14 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586412  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1308  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.22 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.71 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.43 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>