34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0021 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  100 
 
 		 313 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  47.06 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  49.68 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  45.72 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  45.39 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  44.26 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  42.58 
 
 		 337 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  47.7 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  42.86 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  43.69 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.75 
 
 		 334 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  45.54 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  44.3 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  49.5 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  44.31 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  45.58 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.92 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  42.72 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  34.86 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  41.4 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  40.85 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.56 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.56 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.56 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.77 
 
 		 382 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.29 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.43 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.05 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  30.32 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  28.26 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.71 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.62 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  30.86 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>