44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2027 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 335 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  82.39 
 
 		 392 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  59.22 
 
 		 388 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  55.63 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  56.19 
 
 		 347 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  55.85 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  53.35 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  54.7 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  53.67 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  55.63 
 
 		 363 aa  301  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  53.95 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  52.35 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.51 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  45.3 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  45.95 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  41.98 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  43.3 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  38.73 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  45.22 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.72 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  36.36 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  38.69 
 
 		 372 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  32.12 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.56 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.45 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.59 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.84 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.08 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30.26 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  28.47 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.86 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  28.52 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.38 
 
 		 410 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.24 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.97 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  27.54 
 
 		 402 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  29.63 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.4 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2770  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.56 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.271017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  29.73 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.73 
 
 		 410 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.52 
 
 		 403 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30.87 
 
 		 400 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>