20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2311 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  100 
 
 		 347 aa  674    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  77.87 
 
 		 348 aa  566  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  67.53 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  28.08 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  28.95 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  24.1 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  24.77 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  29.62 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  26.35 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  26.8 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  25.44 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  25.81 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  30.29 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  22.84 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  19.94 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  26.49 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  25.18 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.88 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>