27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1764 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  100 
 
 		 373 aa  743    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  49.73 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  42.4 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  38.81 
 
 		 486 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.77 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  38.53 
 
 		 501 aa  229  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.83 
 
 		 487 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.36 
 
 		 482 aa  222  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.05 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.01 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  28.49 
 
 		 641 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.56 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  29.26 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  29.23 
 
 		 641 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  29.7 
 
 		 642 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  30.14 
 
 		 651 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.72 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  26.79 
 
 		 424 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.38 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.84 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.01 
 
 		 137 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  26.27 
 
 		 158 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.03 
 
 		 148 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.49 
 
 		 149 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02690  damaged DNA binding protein, putative  26.99 
 
 		 597 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  22.89 
 
 		 533 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>