More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1569 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  62.66 
 
 
233 aa  278  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  55.05 
 
 
230 aa  230  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  47.09 
 
 
236 aa  201  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  51.87 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  53.05 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  51.85 
 
 
241 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  45.07 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  46.45 
 
 
229 aa  190  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  45.79 
 
 
235 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  49.53 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  48.83 
 
 
234 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  48.18 
 
 
225 aa  186  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  50.74 
 
 
239 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  48.36 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  49.77 
 
 
225 aa  176  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  48.36 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  47.71 
 
 
225 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  39.83 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  36.99 
 
 
224 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  38.61 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  38.21 
 
 
217 aa  125  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  36.77 
 
 
226 aa  121  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  35.9 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.22 
 
 
232 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  34.36 
 
 
231 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  37.64 
 
 
217 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  37.5 
 
 
217 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  38.76 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  28.31 
 
 
229 aa  89  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  29.34 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  32.8 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  28.75 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  28.57 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  27.85 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  28.44 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  28.15 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  29.54 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  29.41 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  28.93 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  30.98 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  27.85 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  27 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  30.16 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  27.27 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  30.98 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  27.27 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.96 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  28.1 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  27 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  27 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  33.33 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  26.36 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  29.05 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  35.62 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  29.94 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  32.24 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  28.7 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  32.59 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  29.9 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  27.07 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  30.09 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  26.13 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  30.56 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  32.59 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  24.89 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  32.34 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.83 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  30.56 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  29.89 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  33.56 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  33.11 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  28.49 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  32.34 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  33.06 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  33.12 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  31.55 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  36.11 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  27.73 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  25.52 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  29.94 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  35.57 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  26.03 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  31.51 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  29.17 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  31.25 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  31.91 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  36.11 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  29.03 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  29.03 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  30.72 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  33.52 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  30.43 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  28 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  33.11 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  28.43 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  34.13 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  31.05 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  34.13 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  28 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>