36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0309 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  67.8 
 
 
253 aa  338  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  48.13 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  47.9 
 
 
237 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  43.28 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  40.77 
 
 
247 aa  178  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  39.74 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  39.32 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  39.13 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  38.3 
 
 
247 aa  164  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  38.49 
 
 
238 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  42.86 
 
 
243 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  38.67 
 
 
247 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  36.49 
 
 
243 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  37.1 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  43.92 
 
 
255 aa  131  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  37.66 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  39.79 
 
 
245 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  34.48 
 
 
250 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  37.17 
 
 
244 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  31.73 
 
 
249 aa  105  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  35 
 
 
249 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  31.41 
 
 
277 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  36 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  30.85 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  32.12 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  27.55 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  37.78 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  36.29 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  28.77 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  35.66 
 
 
312 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  34.11 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  37.37 
 
 
305 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  39.23 
 
 
281 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>