27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1348 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  91.41 
 
 
206 aa  358  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  51.96 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  50.74 
 
 
197 aa  177  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  50.25 
 
 
196 aa  175  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  49.26 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  49.75 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  47.72 
 
 
192 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  47.78 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  43.81 
 
 
189 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  38.34 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  38.19 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  35.81 
 
 
201 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  35.35 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  38.92 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  35.42 
 
 
170 aa  101  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  36 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  35.29 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  30.73 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  50 
 
 
91 aa  61.6  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  31.31 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  43.55 
 
 
310 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  38.33 
 
 
302 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  24 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  36 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3419  flagellin  23.44 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0966  flagellin protein  28.1 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>