242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1771 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  53.69 
 
 
1293 aa  833    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1343 aa  2759    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  53.95 
 
 
1285 aa  860    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  32.49 
 
 
1426 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  33.23 
 
 
1258 aa  716    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  41.53 
 
 
1239 aa  643    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  33.84 
 
 
1237 aa  693    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  35.28 
 
 
1244 aa  767    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  47.02 
 
 
1192 aa  665    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  56.4 
 
 
1266 aa  1569    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  47.57 
 
 
1270 aa  722    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  32.58 
 
 
1256 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  48.52 
 
 
1297 aa  745    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  38.5 
 
 
1291 aa  875    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  32.81 
 
 
1255 aa  634  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  31.47 
 
 
1298 aa  625  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  32.3 
 
 
1238 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  29.81 
 
 
1302 aa  620  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  30.91 
 
 
1453 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0109  cobaltochelatase subunit CobN  42.36 
 
 
1229 aa  611  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.317213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3311  magnesium chelatase subunit H  32.79 
 
 
1328 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0712656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  30.11 
 
 
1207 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  29.84 
 
 
1304 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  30.67 
 
 
1263 aa  578  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  31.36 
 
 
1406 aa  572  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  30.63 
 
 
1329 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  30.85 
 
 
1253 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  29.62 
 
 
1364 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  31.69 
 
 
1330 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  31.69 
 
 
1330 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  30.22 
 
 
1290 aa  559  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  31.18 
 
 
1244 aa  556  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  29.8 
 
 
1257 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45384  predicted protein  31.28 
 
 
1336 aa  554  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00403917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  30.2 
 
 
1253 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  30.35 
 
 
1253 aa  552  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1048  magnesium chelatase, H subunit  30.58 
 
 
1273 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.115422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  30.31 
 
 
1253 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1436  magnesium chelatase, H subunit  29.79 
 
 
1273 aa  539  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.958872  normal  0.470699 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2137  magnesium chelatase subunit H  30.44 
 
 
1328 aa  539  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67414  normal  0.220036 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  30.84 
 
 
1336 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0969  magnesium chelatase subunit H  30.96 
 
 
1336 aa  536  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.72358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10391  magnesium chelatase subunit H  30.56 
 
 
1336 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0255  magnesium-chelatase, subunit H  28.43 
 
 
1267 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.409293  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  30.21 
 
 
1339 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09061  magnesium chelatase subunit H  30.71 
 
 
1335 aa  529  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  29.84 
 
 
1281 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0380  magnesium chelatase subunit H  30.8 
 
 
1337 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.582588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10621  magnesium chelatase subunit H  30.86 
 
 
1337 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  29.21 
 
 
1343 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2311  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.98 
 
 
1267 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0576549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  29.76 
 
 
1245 aa  519  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1794  magnesium chelatase, H subunit  28.95 
 
 
1280 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  32.85 
 
 
1249 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1542  magnesium chelatase subunit H  29.34 
 
 
1283 aa  516  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0156195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2154  magnesium chelatase, H subunit  28.56 
 
 
1267 aa  512  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0227  magnesium-chelatase, subunit H  27.92 
 
 
1266 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2581  magnesium chelatase, H subunit  28.27 
 
 
1267 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2205  magnesium chelatase, H subunit  28.63 
 
 
1269 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  31.94 
 
 
1286 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  30.91 
 
 
1388 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  30.23 
 
 
1347 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0376  cobaltochelatase  31.89 
 
 
1187 aa  505  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0314903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0228  cobaltochelatase  31.89 
 
 
1187 aa  505  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  28.89 
 
 
1263 aa  499  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  28.81 
 
 
1263 aa  496  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.73 
 
 
1245 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2313  magnesium chelatase subunit H  29.31 
 
 
1280 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.227172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.64 
 
 
1245 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.89 
 
 
1245 aa  483  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2156  magnesium chelatase subunit H  29.83 
 
 
1277 aa  483  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.992629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1969  magnesium chelatase, H subunit  27.56 
 
 
1268 aa  479  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.291202  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.26 
 
 
1253 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2207  magnesium chelatase subunit H  28.5 
 
 
1277 aa  473  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2583  magnesium chelatase subunit H  29 
 
 
1276 aa  466  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.01 
 
 
1242 aa  465  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3099  cobaltochelatase  28.24 
 
 
1243 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.723092 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.53 
 
 
1259 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1795  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.4 
 
 
2113 aa  450  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  29.39 
 
 
1262 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0253  magnesium chelatase subunit H  28.14 
 
 
1296 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  27.96 
 
 
1277 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  43.87 
 
 
1264 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2089  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.43 
 
 
1152 aa  402  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  35.84 
 
 
1207 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  37.25 
 
 
1220 aa  385  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  41.61 
 
 
1222 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  41.51 
 
 
1222 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  39.47 
 
 
1191 aa  382  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  40.57 
 
 
1190 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  40.66 
 
 
1206 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  40.33 
 
 
1193 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  40.96 
 
 
1259 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1275  Cobaltochelatase  41.1 
 
 
1250 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  39.73 
 
 
1379 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  41.08 
 
 
1199 aa  373  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  39.72 
 
 
1209 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1022  Cobaltochelatase  42.59 
 
 
1250 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.550744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  40.57 
 
 
1212 aa  373  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  40.61 
 
 
1198 aa  370  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>