60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1323 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3244  hypothetical protein  37.76 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169883  normal  0.013154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  38.16 
 
 
289 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2208  hypothetical protein  37.46 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1339  hypothetical protein  38.81 
 
 
292 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3812  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.78 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2424  hypothetical protein  32.13 
 
 
296 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00888453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3717  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
288 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3106  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0076557 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  28.16 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  26.89 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5252  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000956104  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  23.33 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  23.33 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  25.23 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  24.52 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  23.77 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  25.89 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
290 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  22.82 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  23.04 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  24.65 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  21.65 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  28.36 
 
 
137 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  20.89 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  26.67 
 
 
138 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.37 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  22.73 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
143 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  21.86 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  21.77 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  23.63 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  26.39 
 
 
140 aa  46.2  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92750  predicted protein  28.46 
 
 
380 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0573046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.33 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  27.01 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2597  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.17 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.760642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.85 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  27.18 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  23.34 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  25.76 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  25.76 
 
 
142 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.86 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  25.24 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  22.03 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  21.01 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  25.24 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  25.24 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  28.36 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  26.67 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
137 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>