45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2847 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  43.61 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  41.89 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  37.09 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  41.64 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.74 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  39.73 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  41.58 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  39.39 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  39.73 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  39.06 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  40.07 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  40.07 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  40.4 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  36.54 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  38.35 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  38.14 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  37.37 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  37.33 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  34.19 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  35.84 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  34.81 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  33.23 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  32.67 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  35.59 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  35.31 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  30.33 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  30.33 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  36.36 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  32.99 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  29.87 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  27.3 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  29.05 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  27.39 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  30.33 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  28.43 
 
 		 323 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  28.32 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  29.08 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  30.05 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  21.65 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  29.19 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>