More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0343 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  100 
 
 
645 aa  1294    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  56.04 
 
 
637 aa  674    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2304  heavy metal translocating P-type ATPase  36.86 
 
 
686 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
712 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
712 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.63 
 
 
767 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
712 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
625 aa  412  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  37.38 
 
 
639 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
707 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.22 
 
 
889 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
889 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.53 
 
 
818 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.56 
 
 
709 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0093  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 
619 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  38.8 
 
 
656 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  36.8 
 
 
798 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
783 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
894 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38.29 
 
 
833 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1366  heavy metal translocating P-type ATPase  34.19 
 
 
622 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  34.89 
 
 
623 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
713 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
699 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
797 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
737 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.98 
 
 
805 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.62 
 
 
797 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.12 
 
 
628 aa  381  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 
643 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
836 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.44 
 
 
785 aa  382  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.21 
 
 
794 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
796 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.72 
 
 
667 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.81 
 
 
817 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
806 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
821 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 
868 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  38.35 
 
 
718 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  34.98 
 
 
803 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  37.26 
 
 
679 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
798 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
815 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
806 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  36.68 
 
 
805 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  35.39 
 
 
743 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
798 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  36.85 
 
 
805 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.85 
 
 
806 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  35.52 
 
 
616 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  36.52 
 
 
805 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.52 
 
 
805 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  36.52 
 
 
805 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.73 
 
 
976 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
734 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  37.41 
 
 
792 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  36.52 
 
 
805 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  35.9 
 
 
857 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 
810 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
737 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  37.75 
 
 
836 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  34.7 
 
 
804 aa  363  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  33.8 
 
 
735 aa  363  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 
827 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  33.23 
 
 
926 aa  362  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
758 aa  362  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
826 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  34.31 
 
 
812 aa  362  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
828 aa  361  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
738 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  34.73 
 
 
635 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  36.79 
 
 
839 aa  362  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
828 aa  362  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
753 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
673 aa  361  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  36.72 
 
 
828 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  35.33 
 
 
633 aa  361  3e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  38.14 
 
 
822 aa  360  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  34.59 
 
 
809 aa  360  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21740  heavy metal translocating P-type ATPase  36.69 
 
 
631 aa  360  5e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000439315  normal  0.410793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
723 aa  359  7e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  33.12 
 
 
634 aa  359  8e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.91 
 
 
751 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
747 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
827 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  34.76 
 
 
1022 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  42.27 
 
 
824 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  36.57 
 
 
639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
750 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  37.03 
 
 
821 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  33 
 
 
640 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 
825 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 
833 aa  357  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  35.37 
 
 
620 aa  357  5e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
723 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
786 aa  356  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  33.88 
 
 
639 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>