128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0212 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0206  phosphoesterase, RecJ-like protein  69.65 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.773768  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  43.48 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0709  phosphoesterase domain-containing protein  33.93 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1246  phosphoesterase domain-containing protein  33.96 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1429  phosphoesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0643  phosphoesterase domain-containing protein  33.63 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0245262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1257  phosphoesterase domain-containing protein  32.41 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1122  phosphoesterase RecJ domain protein  30.48 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1715  phosphoesterase domain-containing protein  28 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0829  phosphoesterase domain-containing protein  27.24 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1944  phosphoesterase domain-containing protein  27.64 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.754503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0929  phosphoesterase domain-containing protein  25 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  26.79 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  28.66 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0654  phosphoesterase, DHHA1  25.94 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0418861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  22.8 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1374  phosphoesterase domain-containing protein  24.72 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.196135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  23.97 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0419  phosphoesterase, DHH family protein  25.14 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  25.96 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  30.49 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  25.39 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  26.4 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  25.15 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  25.31 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  24.6 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  25.68 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  22.15 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  26.67 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  28 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0124  phosphoesterase RecJ domain protein  24.03 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00235664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0661  phosphoesterase domain-containing protein  26.79 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  24.92 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  22.78 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  24.44 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  27.81 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  24.62 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  25.08 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  25.36 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2210  phosphoesterase RecJ domain protein  34.83 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00226161  decreased coverage  0.000527664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  26.75 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  24.32 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  24.32 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  25.78 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  24.5 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.36 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.52 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  24.77 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  25.79 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1064  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  28.85 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  0.0224811 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  23.34 
 
 		 511 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  29.59 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  24.66 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  22.52 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  33.33 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  28.57 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  22.46 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  26.02 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  24.88 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  42.11 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  24.45 
 
 		 489 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  25.65 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  25.65 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  24.66 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  24.66 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  28.39 
 
 		 497 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  26.32 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  24.63 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  26.5 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  27.36 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  24.83 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  24.32 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  24.32 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  24.32 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  25.51 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  22.62 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  24.32 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.8 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  29.41 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  24.19 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  24.5 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  24.74 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  28.74 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  25.93 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  24.22 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  25.08 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  30.54 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  21.52 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  23.18 
 
 		 487 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  25.3 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.48 
 
 		 461 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  29.11 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  31.53 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3754  phosphoesterase domain-containing protein  26.04 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0331938  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>