More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3814 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3814  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
210 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0290  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.5 
 
 
206 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2947  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.72 
 
 
197 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.88 
 
 
200 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1373  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.62 
 
 
200 aa  158  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.55479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.37 
 
 
200 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.07 
 
 
202 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3310  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.57 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0797  hypothetical protein  41.12 
 
 
202 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.340002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1463  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.1 
 
 
200 aa  148  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1334  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1066  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42 
 
 
201 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3029  hypothetical protein  38.5 
 
 
194 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.415744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3095  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.56 
 
 
200 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.103088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.31 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  33.82 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  33.82 
 
 
198 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4878  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.32 
 
 
198 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4615  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.32 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4825  MarC membrane protein  37.32 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.495877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4700  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.32 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.561247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64240  MarC family protein  36.32 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0206769  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5577  hypothetical protein  36.32 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.53 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.03 
 
 
201 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  31.4 
 
 
208 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.38 
 
 
202 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36 
 
 
206 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.03 
 
 
206 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.18 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.5 
 
 
206 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.18 
 
 
206 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.5 
 
 
206 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.71 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  32.16 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.33 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.53 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  29.67 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.85 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.85 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.71 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.04 
 
 
206 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  33.51 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.98 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.47 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  27.86 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.26 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.53 
 
 
211 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.14 
 
 
215 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.5 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.41 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.41 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  27.86 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  31.15 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.12 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  27.86 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  27.86 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  27.86 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0082  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.24 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.21 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  27.86 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.38 
 
 
210 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  32.04 
 
 
209 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.95 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  31.55 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  30.53 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  30.53 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>