29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0399 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  62.75 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5274  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  47.37 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4735  DNA polymerase beta subunit  52.24 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  37.78 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  29.52 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0678  DNA polymerase beta domain protein region  29.79 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  30.63 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  29.79 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  28.57 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  35.53 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  26.53 
 
 		 116 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0793  DNA polymerase, beta-like region  30.34 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1200  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 111 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 121 aa  41.6  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  41.82 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  51.52 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  31.65 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2353  DNA polymerase beta domain protein region  46.81 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  42.62 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  35.48 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>