176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2292 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  223  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  71.84 
 
 		 117 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  71.84 
 
 		 115 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  71.84 
 
 		 115 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  69.52 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  68.57 
 
 		 116 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  66.02 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  51.96 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  42.06 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  38 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  40.4 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  38.61 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  40.59 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  34.62 
 
 		 343 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  37.89 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  28.43 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  33.66 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  32.11 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  32.11 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  30.28 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  28.16 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  34.31 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  30.43 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  35.42 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  35.42 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.4 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  26.47 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  34.31 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  33.64 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  33.33 
 
 		 677 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.89 
 
 		 408 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  34.34 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  34.34 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  31.31 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  30.56 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  31.31 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.84 
 
 		 410 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  30.39 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 614 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 595 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  32.32 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 		 572 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  38.14 
 
 		 597 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.32 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  32.65 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.1 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  31.31 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 		 597 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  29.41 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.04 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 		 596 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.63 
 
 		 410 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  31.63 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  32.67 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.37 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  31.68 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  36.54 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  30.3 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  29.91 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  32 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  36.9 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  34.41 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2933  hypothetical protein  35.05 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.350772  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  31.68 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  31.68 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 		 597 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  30.3 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  28.28 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0844  putative iron-sulfur cluster-binding protein  31.31 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.923972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  30.61 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.96 
 
 		 597 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  31.68 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  32 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  37.5 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 		 626 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  27.72 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  32 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  32 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  32 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  29.41 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  28.71 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 		 602 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  28.28 
 
 		 610 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  32.61 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  31.91 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 		 562 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 		 572 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  34.62 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  31.07 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  31.48 
 
 		 624 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 598 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 		 607 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 		 607 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>