116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2181 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2181  cytochrome c family protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1680  cytochrome c family protein  59.74 
 
 		 170 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02730  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6191  aspartate carbamoyltransferase  50.68 
 
 		 197 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4601  hypothetical protein  51.54 
 
 		 169 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2185  putative lipoprotein  40.19 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0986  hypothetical protein  34.51 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.786358  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  41.89 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  33.94 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  33.94 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  37.84 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  33.64 
 
 		 116 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  36.36 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  30.28 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  32.05 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  37.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  32.11 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2118  cytochrome c class I  34.09 
 
 		 123 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343097  normal  0.41454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  35.14 
 
 		 157 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  36.36 
 
 		 134 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 112 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  38.16 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  37.18 
 
 		 140 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  34.88 
 
 		 148 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  35.62 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2303  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  36.11 
 
 		 382 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  35 
 
 		 164 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  30.38 
 
 		 97 aa  52.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  31.65 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 112 aa  52.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  35.9 
 
 		 110 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110389  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  35.44 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  32.91 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  36 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  36.11 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  37.36 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  31.31 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  30.38 
 
 		 97 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  37.36 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  34.18 
 
 		 111 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  32.47 
 
 		 97 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  28.87 
 
 		 101 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  38.36 
 
 		 537 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  38.36 
 
 		 537 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 103 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  34.67 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 107 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  27.85 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0184  cytochrome c, class I  34.09 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  29.87 
 
 		 97 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 111 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0948  cytochrome c family protein  27.06 
 
 		 123 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  26.26 
 
 		 99 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 99 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  26.26 
 
 		 99 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  26.26 
 
 		 99 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  41.82 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  35.44 
 
 		 161 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  33.77 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  27.5 
 
 		 97 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  26.26 
 
 		 99 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 128 aa  45.4  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 299 aa  45.4  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 167 aa  45.4  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  30.53 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  32.89 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.388168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>