More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1339 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 135 aa  241  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 135 aa  241  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  82.96 
 
 		 135 aa  230  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  76.69 
 
 		 135 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  72.93 
 
 		 144 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  69.17 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  69.17 
 
 		 144 aa  196  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  69.17 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  69.92 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  69.92 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  69.17 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  69.17 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  69.17 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  67.67 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 144 aa  167  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  63.2 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  62.4 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  48.41 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.6 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  42.4 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39.37 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  43.2 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.53 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.98 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.48 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.8 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 147 aa  93.2  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 172 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.6 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  40.35 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  38.28 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  38.28 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>