71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0781 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0781  cytochrome c family protein  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4208  cytochrome c class I  58.82 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0400385  normal  0.12753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4148  cytochrome c class I  55.13 
 
 		 205 aa  168  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.37393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4516  cytochrome c class I  55.13 
 
 		 197 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0581555  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0473  cytochrome c class I  50 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4630  cytochrome c class I  56.62 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1909  cytochrome c, class I  50.96 
 
 		 206 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  51.57 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8038  cytochrome c class I  52.94 
 
 		 202 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896998  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2042  cytochrome c, class I  50.34 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2995  cytochrome c, class I  49.33 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00916007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2312  cytochrome c, class I  34.03 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0109584  hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.33 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  32.22 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  51.52 
 
 		 269 aa  47.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  28.72 
 
 		 346 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.74 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0716  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 299 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000848569  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.55 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.55 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  26.44 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  26.51 
 
 		 381 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  29.79 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.41 
 
 		 339 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1450  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.41 
 
 		 339 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.67 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  28.69 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  30.26 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  26 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.23 
 
 		 311 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  29.41 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.79 
 
 		 325 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.41 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5245  cytochrome c class I  29.82 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.34 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  45 
 
 		 324 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.92 
 
 		 304 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.6 
 
 		 723 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.14 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  29.67 
 
 		 163 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  25.49 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.92 
 
 		 322 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 187 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.9 
 
 		 318 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  34.62 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  29.9 
 
 		 318 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  33.33 
 
 		 718 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  25.49 
 
 		 296 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1219  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.16 
 
 		 343 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.983776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.94 
 
 		 325 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  30.63 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.73 
 
 		 461 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.92 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.92 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.92 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.92 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  36.92 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  45 
 
 		 324 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 421 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  29.55 
 
 		 327 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>