More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01286 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01286  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  100 
 
 
344 aa  684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  35.88 
 
 
662 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  36 
 
 
675 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  38.41 
 
 
660 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  35.4 
 
 
684 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  37.22 
 
 
660 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  36.25 
 
 
656 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  32.77 
 
 
690 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.26 
 
 
616 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.75 
 
 
695 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  35.24 
 
 
640 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  36.18 
 
 
734 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.23 
 
 
695 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  33.33 
 
 
777 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  32.14 
 
 
629 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  33.53 
 
 
629 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  32.58 
 
 
643 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  32.29 
 
 
690 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  36.66 
 
 
639 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  32.55 
 
 
675 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  35.84 
 
 
635 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  35.44 
 
 
629 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  32.91 
 
 
637 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  37.14 
 
 
642 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  34.55 
 
 
681 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  32.02 
 
 
660 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  33.02 
 
 
647 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  34.13 
 
 
710 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  34.13 
 
 
710 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  38.55 
 
 
682 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  35.09 
 
 
671 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  35.16 
 
 
632 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  33.74 
 
 
679 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  33.54 
 
 
645 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  34.8 
 
 
658 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  32.25 
 
 
679 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.97 
 
 
635 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  32.73 
 
 
667 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  35.35 
 
 
673 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  33.22 
 
 
634 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  31.16 
 
 
695 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  30.7 
 
 
651 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30.06 
 
 
656 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  31.69 
 
 
716 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  31.72 
 
 
720 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.64 
 
 
675 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  33.44 
 
 
644 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  31.71 
 
 
715 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  32.6 
 
 
690 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  31.97 
 
 
615 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  30.64 
 
 
720 aa  139  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  31.82 
 
 
711 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  32.82 
 
 
660 aa  139  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  31.64 
 
 
645 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.62 
 
 
662 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  30.79 
 
 
665 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  32 
 
 
660 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  33.13 
 
 
676 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  33.91 
 
 
688 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  33.23 
 
 
598 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  30.79 
 
 
683 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  34.6 
 
 
665 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  35.03 
 
 
636 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  33.23 
 
 
630 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  32.43 
 
 
603 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  37.73 
 
 
759 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  31.76 
 
 
657 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  31.72 
 
 
726 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  31.72 
 
 
726 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  31.72 
 
 
726 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  31.41 
 
 
657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  33.04 
 
 
685 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  33.43 
 
 
607 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  30.98 
 
 
690 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  31.73 
 
 
658 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  33.53 
 
 
690 aa  129  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  31.23 
 
 
658 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.55 
 
 
718 aa  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  32.13 
 
 
628 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  31.91 
 
 
662 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.12 
 
 
638 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  29.66 
 
 
675 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  31.11 
 
 
722 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  32.7 
 
 
691 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  29.22 
 
 
603 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  29.22 
 
 
603 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  30.88 
 
 
627 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  28.78 
 
 
428 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  33.23 
 
 
647 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05810  predicted acyltransferase  30.96 
 
 
705 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.550505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  32.59 
 
 
583 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.41 
 
 
671 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  33.33 
 
 
626 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  30.47 
 
 
675 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  34.44 
 
 
652 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  33.44 
 
 
725 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  29.01 
 
 
760 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  29.39 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  32.57 
 
 
642 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  33.45 
 
 
654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>