31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6671 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  100 
 
 
755 aa  1484    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.33 
 
 
1789 aa  82.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  33.75 
 
 
940 aa  82  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.36 
 
 
1925 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  35.26 
 
 
1809 aa  77.8  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  30.49 
 
 
679 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.56 
 
 
3598 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.88 
 
 
4798 aa  72  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.14 
 
 
1814 aa  71.2  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.22 
 
 
4687 aa  70.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.68 
 
 
2107 aa  70.5  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  30.49 
 
 
541 aa  68.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.57 
 
 
959 aa  64.7  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.41 
 
 
1499 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.64 
 
 
1480 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  28.48 
 
 
844 aa  63.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  29.94 
 
 
960 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  29.82 
 
 
2682 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  24.54 
 
 
3209 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  28.15 
 
 
585 aa  58.5  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.94 
 
 
999 aa  58.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.83 
 
 
2767 aa  57.4  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  24.84 
 
 
618 aa  56.6  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  27.67 
 
 
1805 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  26.67 
 
 
582 aa  55.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  34.95 
 
 
337 aa  54.3  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.83 
 
 
1607 aa  54.3  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  33.07 
 
 
1306 aa  54.3  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  27.86 
 
 
428 aa  51.2  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  31.2 
 
 
351 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  29.35 
 
 
1112 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>