40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1041 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1041  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  86.62 
 
 
285 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1850  hypothetical protein  71.23 
 
 
292 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22546  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4102  hypothetical protein  69.5 
 
 
284 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1668  hypothetical protein  69.71 
 
 
290 aa  348  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0390107  normal  0.64183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1571  hypothetical protein  75.44 
 
 
228 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48041  normal  0.0731359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  39.71 
 
 
288 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 
300 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  40.16 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  25.13 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  25.49 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  40.74 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
342 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
299 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.15 
 
 
298 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
329 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>