37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0140 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  306  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  54 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  48.78 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  48.65 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  44.53 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  45.76 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  39.2 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  39.13 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  35.22 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  34.84 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  36.07 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  32.79 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  34.15 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  30.89 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  29.27 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.32 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  24.82 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  29.23 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  34.48 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  33.06 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  33.7 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  35.34 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30.19 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.11 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.46 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  31.58 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  34.74 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  30.53 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  28.21 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  23.33 
 
 		 270 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  25.85 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  27.1 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>