177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0886 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0886  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
124 aa  253  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0015  aromatic compounds catabolism protein  52.03 
 
 
124 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  46.08 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  45.92 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  37.7 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1857  aromatic compounds catabolism protein  32.52 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  35.9 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  35.9 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  35.9 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  33.62 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  33.62 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  33.62 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  33.62 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  33.62 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  33.62 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  33.62 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  40.78 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  31.3 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  33.62 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  33.62 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  32.26 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  32.48 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  36.89 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  37.86 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  34.95 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  37.86 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
134 aa  66.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  37.86 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  37.86 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  37.86 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  38.24 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0870  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  30.83 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  36.89 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  34.68 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  30.33 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  37.86 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  29.17 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.84 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  32.26 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  35.29 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  34.31 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  40.24 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  30.89 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  31.71 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  29.75 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  29.75 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  29.75 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0278  aromatic compounds catabolism protein  44.19 
 
 
87 aa  62  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  29.75 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  29.75 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  28.07 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  33 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  32.41 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  32.23 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  32.41 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  36.46 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  32.35 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>