179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0870 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0870  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  56.3 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  55 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  53.85 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  53.85 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  53.85 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  54.95 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  46.04 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  52.75 
 
 		 134 aa  100  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  33.62 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0015  aromatic compounds catabolism protein  36.96 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0886  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  31.82 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  30.17 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  30.17 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  29.31 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  25.6 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  25.6 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  25.6 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  25.6 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  25.6 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  26.71 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  25.6 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.67 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  29.82 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  29.31 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  25.6 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  25.6 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  31.87 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  35.51 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  31.87 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  29.81 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  25.62 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  29.52 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  30.91 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  32 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  32.08 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  29.92 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  30.97 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  32.38 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  26.47 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  26.23 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  27.2 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  31.53 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  23.14 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  30.15 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  27.03 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  31.53 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  27.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  32.73 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  27.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  27.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  27.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>