34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0883 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  100 
 
 		 962 aa  1974    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1829  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 937 aa  309  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  22.54 
 
 		 888 aa  145  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  20.72 
 
 		 933 aa  144  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  23.85 
 
 		 892 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  23.73 
 
 		 894 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  21.38 
 
 		 859 aa  86.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  24.94 
 
 		 1140 aa  68.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  31.93 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 871 aa  62.4  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  22.37 
 
 		 880 aa  62  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  20.32 
 
 		 869 aa  61.6  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  20.81 
 
 		 883 aa  62  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  21.39 
 
 		 957 aa  61.6  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  33.67 
 
 		 822 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  38.67 
 
 		 856 aa  54.7  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  29.1 
 
 		 859 aa  53.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  44.83 
 
 		 964 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  36.23 
 
 		 823 aa  53.5  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  28.95 
 
 		 623 aa  52.8  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  28.28 
 
 		 818 aa  52  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  31.31 
 
 		 815 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  31.63 
 
 		 726 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  40 
 
 		 1047 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0809  hypothetical protein  20.13 
 
 		 866 aa  47  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00005758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  28.87 
 
 		 810 aa  47  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  32.81 
 
 		 821 aa  46.2  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  35.38 
 
 		 801 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  25.35 
 
 		 798 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  32.76 
 
 		 795 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2238  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1011 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  35.38 
 
 		 801 aa  45.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1045 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  35.71 
 
 		 809 aa  44.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>