19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1996 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1270    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  52.84 
 
 		 859 aa  610  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  38.49 
 
 		 883 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  22.98 
 
 		 871 aa  126  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  23.91 
 
 		 869 aa  109  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  22.93 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  22.88 
 
 		 903 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  23.67 
 
 		 859 aa  82  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  23.14 
 
 		 964 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  22.14 
 
 		 888 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  22.64 
 
 		 892 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  22.11 
 
 		 894 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  28.95 
 
 		 962 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1326  hypothetical protein  21.97 
 
 		 868 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0986075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1301  membrane protein-like protein  21.97 
 
 		 868 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000816869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  37.93 
 
 		 957 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  28.57 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  24.58 
 
 		 809 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  30 
 
 		 847 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>