16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8841 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  100 
 
 
964 aa  1939    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  25.3 
 
 
869 aa  219  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  22.38 
 
 
883 aa  183  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  21.42 
 
 
859 aa  162  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  23.4 
 
 
871 aa  160  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  21.35 
 
 
880 aa  137  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  22.99 
 
 
903 aa  126  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  27.37 
 
 
859 aa  100  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  20.26 
 
 
892 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  23.48 
 
 
894 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  28.93 
 
 
1140 aa  60.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  26.14 
 
 
888 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  44.83 
 
 
962 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  22.5 
 
 
623 aa  52.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  22.91 
 
 
933 aa  49.3  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  37.68 
 
 
823 aa  48.1  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>