14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1388 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 859 aa  1699    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  30.33 
 
 		 871 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  30.9 
 
 		 880 aa  342  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  29.72 
 
 		 869 aa  340  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  27.65 
 
 		 859 aa  223  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  25.2 
 
 		 883 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  24.39 
 
 		 903 aa  183  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  24.47 
 
 		 964 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  24.26 
 
 		 623 aa  100  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  22.89 
 
 		 892 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  22.48 
 
 		 894 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  21.07 
 
 		 888 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  28 
 
 		 962 aa  58.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  21.54 
 
 		 933 aa  52.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>