17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  100 
 
 		 933 aa  1906    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  32.51 
 
 		 957 aa  425  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  23.24 
 
 		 888 aa  183  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  23.17 
 
 		 894 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  22.18 
 
 		 892 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  20.7 
 
 		 962 aa  148  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1829  glycosyltransferase  19.87 
 
 		 937 aa  86.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  26.03 
 
 		 883 aa  59.3  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  19.9 
 
 		 869 aa  52  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  36 
 
 		 903 aa  51.2  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  23.75 
 
 		 880 aa  50.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  20.32 
 
 		 871 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0809  hypothetical protein  18.8 
 
 		 866 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00005758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  22.55 
 
 		 964 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  27.46 
 
 		 1140 aa  47.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  42.31 
 
 		 870 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  39.71 
 
 		 726 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>