20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0277 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 903 aa  1817    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 871 aa  279  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  29.32 
 
 		 869 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  27.19 
 
 		 880 aa  234  6e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  25.55 
 
 		 883 aa  179  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  24.04 
 
 		 859 aa  163  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  23.84 
 
 		 859 aa  157  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  22.54 
 
 		 964 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  23.01 
 
 		 888 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14370  membrane protein YfhO  21.29 
 
 		 957 aa  87.8  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  33.86 
 
 		 962 aa  78.6  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  22.68 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  34.78 
 
 		 894 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  28.15 
 
 		 1140 aa  69.3  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  30.17 
 
 		 892 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  38.67 
 
 		 933 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0809  hypothetical protein  26.9 
 
 		 866 aa  49.3  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00005758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  26.47 
 
 		 800 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  32.35 
 
 		 870 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1829  glycosyltransferase  40 
 
 		 937 aa  45.8  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>