20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0473 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  100 
 
 
869 aa  1757    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  37.4 
 
 
880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  38.5 
 
 
871 aa  568  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  28.62 
 
 
859 aa  298  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  29.17 
 
 
903 aa  234  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  25.32 
 
 
964 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  25.69 
 
 
883 aa  183  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  23.5 
 
 
859 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  22.81 
 
 
894 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  21.76 
 
 
892 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  22.06 
 
 
888 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  24.22 
 
 
623 aa  95.5  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  20.48 
 
 
962 aa  67.8  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1301  membrane protein-like protein  21.19 
 
 
868 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000816869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1326  hypothetical protein  21.19 
 
 
868 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0986075  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  23.04 
 
 
1140 aa  50.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  29.46 
 
 
825 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  26.67 
 
 
798 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  34.09 
 
 
822 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  19.25 
 
 
933 aa  45.8  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>