19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1245 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1245  hypothetical protein  100 
 
 
880 aa  1765    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.816552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0473  hypothetical protein  37.72 
 
 
869 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1212  membrane protein-like protein  36.57 
 
 
871 aa  525  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000118346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1388  hypothetical protein  31.46 
 
 
859 aa  301  5e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000211838  hitchhiker  2.84061e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0277  hypothetical protein  27.26 
 
 
903 aa  220  8.999999999999998e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0155701  normal  0.111669 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2172  hypothetical protein  24.92 
 
 
859 aa  172  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.272358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0893  hypothetical protein  23.21 
 
 
883 aa  154  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.262906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8841  hypothetical protein  21.24 
 
 
964 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5554  multidrug resistance protein B  22.08 
 
 
892 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5395  multidrug resistance protein B  22.4 
 
 
888 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3949  multidrug resistance protein B  22.37 
 
 
894 aa  88.6  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12000  membrane protein YfhO  26.79 
 
 
1140 aa  70.5  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  23.29 
 
 
962 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1996  hypothetical protein  22.91 
 
 
623 aa  65.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.863405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  37.5 
 
 
870 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14380  membrane protein YfhO  23.75 
 
 
933 aa  50.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.966469  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1829  glycosyltransferase  32.65 
 
 
937 aa  48.5  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  26.74 
 
 
801 aa  45.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.27 
 
 
801 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>