24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4247 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  47.02 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  48.65 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  38.51 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  34.31 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  43.36 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  40.51 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  33.77 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  38.1 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  41.51 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  37.8 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  36.92 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1006 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  38.68 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  37.74 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  37.74 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  58.49 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  35.11 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  31.87 
 
 		 758 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  29.88 
 
 		 735 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  27.37 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  31.14 
 
 		 735 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  41.3 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  40.31 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>