More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4063 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 255 aa  500  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  32.68 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  36.07 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  36.25 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  33.51 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.6 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  34.07 
 
 		 463 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  31.51 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  33.33 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.02 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  27.9 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  27.83 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  36.04 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  26.29 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 307 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  33.49 
 
 		 514 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  36.41 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  34.3 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  31.08 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.67 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  35.45 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  27.92 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  29.28 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  31.45 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  26.29 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  29.6 
 
 		 425 aa  89.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2692  protein serine/threonine phosphatase  28.64 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  30.41 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  33.06 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  24.59 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  31.96 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.96 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  32.69 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 		 302 aa  88.6  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  31.9 
 
 		 505 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  31.08 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  31.84 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.36 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  30.4 
 
 		 417 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  31.11 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.03 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 		 364 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  32.66 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.55 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.82 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  27.13 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  33.99 
 
 		 500 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  30.53 
 
 		 395 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  32.73 
 
 		 463 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  30.63 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.77 
 
 		 467 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  32.28 
 
 		 305 aa  85.5  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.83 
 
 		 287 aa  85.1  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  35.33 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  33.33 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  29.31 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  30.59 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0544  protein serine/threonine phosphatases  26.62 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1212  protein serine/threonine phosphatase  26.89 
 
 		 770 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  30.59 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  32.3 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  31.55 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  33.84 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3279  protein serine/threonine phosphatase  35.42 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0342003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  33.02 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  27.84 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3143  protein serine/threonine phosphatases  28.26 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000847096  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  33.68 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  33.16 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  32.02 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2540  protein serine/threonine phosphatases  32.13 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  27.96 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.19 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1157  protein serine/threonine phosphatase  31.72 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  27.92 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  28.89 
 
 		 597 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0873  protein serine/threonine phosphatase  28.33 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0590  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.18 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  36.18 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>