176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3610 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  100 
 
 		 498 aa  978    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  41.15 
 
 		 539 aa  309  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  35.28 
 
 		 519 aa  293  5e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  43.85 
 
 		 512 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  40 
 
 		 518 aa  253  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  33.2 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  31.75 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  36.63 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  35.12 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  34.73 
 
 		 512 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  37.42 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  35.25 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.08 
 
 		 513 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  34.97 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.56 
 
 		 487 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.1 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.27 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  30.84 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  30.68 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  31.07 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  34.04 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.59 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  30.17 
 
 		 499 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  29.88 
 
 		 505 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  31.77 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.22 
 
 		 519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.56 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.75 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5753  CHAD domain-containing protein  39.39 
 
 		 291 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718185  hitchhiker  0.00000000000775092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.78 
 
 		 504 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  28.75 
 
 		 543 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  33.88 
 
 		 512 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.64 
 
 		 510 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  30.15 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  33.87 
 
 		 512 aa  97.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  32.91 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  32.51 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  31.53 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  31.53 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  35.1 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  32.84 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  32.84 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  32.84 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  34.98 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  32.35 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  32.35 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  35.03 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  32.35 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  32.35 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  32.35 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  32.35 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  30.99 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  32.4 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  29.79 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  35.55 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  33.98 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  37.14 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  29.31 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  33.61 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  34.78 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  34.78 
 
 		 508 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  37.36 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  37.36 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  37.36 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  34.94 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  35.96 
 
 		 208 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  34.78 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  36.19 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  35.1 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  34.3 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  31.4 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  35.1 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  34.98 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  36.27 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  36.27 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.44 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.44 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  29.75 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.44 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  30.8 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  31.28 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  36.59 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  34.3 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  36.59 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  36.59 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  36.59 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  32.39 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  36.21 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  32.38 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  36.45 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  36.26 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  35.63 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  35.44 
 
 		 215 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>