277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1426 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1426  transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  303  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117361  hitchhiker  0.00392431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  40.14 
 
 		 245 aa  123  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.33 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 195 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 252 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 248 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.33 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 258 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 258 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.36 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 242 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  25.74 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.63 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.69 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 239 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  25.19 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 254 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 248 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  28.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  24 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  23.13 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>