57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1148 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  100 
 
 
293 aa  597  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.97 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  27.36 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  27.05 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  26.14 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  27.04 
 
 
298 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
329 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.16 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  22.79 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  23.79 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  26.84 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  22.34 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  26.41 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  26.41 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  23.18 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  23.18 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  23.18 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  23.53 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  24.87 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  22.26 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  22.57 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  22.11 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  23.61 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  23.43 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  22.11 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  22.46 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  20.95 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  20.95 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  22.92 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  20 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  20 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  20 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  20 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  20 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  20 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  23.77 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  25.87 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  25.87 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  25.09 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  27.71 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>