187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0982 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  100 
 
 		 76 aa  150  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  68 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A04  copper chaperone  43.42 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  43.66 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  34.78 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0354  copper chaperone  47.37 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  31.82 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 750 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 723 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 471 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  28.12 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 802 aa  50.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  38.98 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  38.98 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  29.41 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 732 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 889 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  35.29 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 889 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 		 758 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 806 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  30.88 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  35.29 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  35.29 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  35.29 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  35.29 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  37.31 
 
 		 784 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  28 
 
 		 861 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  37.1 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 825 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.43 
 
 		 805 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 818 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  33.82 
 
 		 732 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 857 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  37.31 
 
 		 787 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 806 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  33.82 
 
 		 732 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  32.79 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 805 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.36 
 
 		 782 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.36 
 
 		 788 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.36 
 
 		 782 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 795 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 723 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  32.35 
 
 		 732 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 942 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  32.35 
 
 		 732 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  24.24 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 814 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 		 499 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  32.35 
 
 		 732 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  32.35 
 
 		 732 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  32.35 
 
 		 732 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 806 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2406  heavy metal binding protein  30.99 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  29.69 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  30.99 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  34.29 
 
 		 771 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 837 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 894 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 797 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  30.77 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2118  heavy metal binding protein  30.99 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  30.77 
 
 		 799 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 723 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  27.27 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  29.41 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  25.33 
 
 		 752 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  30.56 
 
 		 828 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  27.94 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 759 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 812 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  31.88 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  27.42 
 
 		 551 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 785 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  32.79 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 734 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  28 
 
 		 904 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  30.88 
 
 		 742 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>