34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3816 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  100 
 
 		 331 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  35.03 
 
 		 439 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  41.8 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  37.01 
 
 		 422 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  33.44 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  32.32 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  33.81 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  34.47 
 
 		 428 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  34.39 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  35.48 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  39.22 
 
 		 392 aa  132  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  38.15 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  38.32 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  38.32 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  32.96 
 
 		 514 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  36.48 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  32.16 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  33.44 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  31.74 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  37.31 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  31.83 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  31.41 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  31.21 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  33.44 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  30.72 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  30.86 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  34.24 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  32.84 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  34.3 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  31.47 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  24.83 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  23.78 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  29.8 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  28.28 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>