35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3748 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  100 
 
 		 434 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  61.98 
 
 		 482 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  61.11 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  59.95 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  59.72 
 
 		 444 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  50.36 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  51.32 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  51.01 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  50.36 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  47.95 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  49.29 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  48.51 
 
 		 408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  46.81 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  45.71 
 
 		 411 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  45.33 
 
 		 389 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  45.33 
 
 		 389 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  45.33 
 
 		 389 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  41.29 
 
 		 493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  44.08 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  40.38 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  26.93 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  25.99 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  26.98 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  27.37 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  24.64 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  30.16 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  24.84 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  25.7 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  25.78 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  30.17 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  23.17 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 664 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>